Kromatografi, çeşitli karışımların bileşenlerini ayırma, tanımlama ve nicel olarak belirleme amacıyla yaygın biçimde kullanılan temel bir analiz yöntemidir. Kromatografi Laboratuvarı’nda üç ana kromatografik cihaz bulunmaktadır: İyon Kromatografisi (iletkenlik dedektörü ile) başlıca katyonların (Sodyum Na⁺, Potasyum K⁺, Kalsiyum Ca²⁺ ve Magnezyum Mg²⁺) ve anyonların (Klorür Cl⁻, Nitrat NO₃⁻ ve Sülfat SO₄²⁻) tayininde; Gaz Kromatografisi (kütle spektrometresi, elektron yakalama dedektörü ve alev iyonlaşma dedektörü ile) uçucu organik moleküller ile gaz bileşiklerinin belirlenmesinde; Sıvı Kromatografisi ise (ultraviyole ve kırılma indisi dedektörleri ile) farklı matrikslerde bulunan polar/apolar, uçucu olmayan organik moleküllerin analizinde kullanılmaktadır. Laboratuvarda ayrıca, çeşitli karışımların organik yükünün tahmin edilmesine yönelik ölçümler için kullanılan bir Toplam Organik Karbon (TOC) Analizörü de mevcuttur.

Bu laboratuvarda gerçekleştirilen deneyler aşağıdaki gibidir:

1. Çözelti hazırlama yöntemleri
2. UV-vis spektrofotometresi kullanılarak yapılan reaksiyon kinetik çalışmaları
3. Nefelometre ile sudaki bulanıklık ölçümü
4. UV-vis spektrofotometre ile suda renk ölçümü
5. pH ölçer ile sudaki pH ölçümü
6. Çeşitli genel ekipmanlarla sudaki katı madde ölçümü
7. Titrasyon düzeneği ile sudaki klorür ölçümü
8. Titrasyon düzeneği ile sudaki alkalinite ölçümü
9. Titrasyon düzeneği ile sudaki asitlik ölçümü
10. Titrasyon düzeneği ile suda sertlik ölçümü
11. Titrasyon düzeneği ile sudaki çözünmüş oksijen ölçümü
12. Çözünmüş oksijen ölçümü ve inkübatör içeren BOD testi
13. HACH LANGE spektrometresi ile sudaki COD ölçümü
14. HACH LANGE spektrometresi ile nitrat ölçümü